標準の MFC アプリケーションであれば CWinApp::InitInstance() にてレジストリの名称登録を行う．

BOOL CMyApp::InitInstance()
{
    SetRegistryKey( "company name" );
}

これでレジストリの登録場所は
HKEY_CURRENT_USER\Software\<company name>\<application name>
となる．
<application name> は EXE 名が自動に設定される．

レジストリの操作は

読込

    CMyApp* pApp =(CMyApp*)AfxGetApp();
    INT i = pApp->GetProfileInt( "MY", "data", 1);

書込

    CFooApp* pApp =(CFooApp*)AfxGetApp();
    pApp->WriteProfileInt( "MY", "data", 1);

にて行える．


SetRegistryKey() を使用すれば，CWinApp::GetProfile*，CWinApp::WriteProfile* にて扱えるのでキーを指定する必要がない．
整数，文字列，バイナリが読み書き可能である．
（afxwin.h のヘッダを参照）

GetProfileBinary() にて得られるバイナリの領域は new BYTE[] で確保されるもののようであるから，使用したら delete しなければならない．

逆に SetRegistryKey() を使用すると CWinApp::m_pszProfileName の設定は無視されてレジストリが格納先になってしまう．

GetProfile 系のメンバ関数を使用していれば INI ファイルに保存しておいたものでも，のちにレジストリがよい場合には SetRegistryKey() の１行を追加するだけでレジストリに格納できる．


参照
他アプリのレジストリ操作
INIファイルを実行ファイルディレクトリに作成する