<input type="submit"

のタグで

onsubmit

が指定されていると，javascript で submit しても onsubmit ハンドラは呼ばれない。
だからマウスで押下した場合と違う処理になってしまう。

マウスで押下と同じ処理にするには，javascript で click するか，onsubmit 内の処理を呼び出してから，submit しなければならない。


参照