アプリケーションのショートカットなどはスタートメニューに登録することが多い．
そのスタートメニューのパスは SHGetSpecialFolderLocation() で取得する．

SHGetSpecialFolderLocation() を CSIDL_STARTUP を指定して呼び出すと，ITEMIDLIST が返る．それを SHGetPathFromIDList などでパス名に変換すればよい．
ちなみにデスクトップのパスを取得するには CSIDL_DESKTOP を指定する．


参照
デスクトップのフォルダ
デスクトップへショートカット登録